دوره 30، شماره 2 - ( تابستان 1402 )
جلد 30 شماره 2 صفحات 140-131 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Research code: IR.IAU.SHK.REC.1402.053
Ethics code: IR.IAU.SHK.REC.1402.053
Clinical trials code: لازم ندارد
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Davoodi M, Zia Jahromi N. Study of lncRNADSCR9 expression rate in colorectal cancer patients. Journals of Birjand University of Medical Sciences 2023; 30 (2) :131-140
URL: http://journal.bums.ac.ir/article-1-3294-fa.html
URL: http://journal.bums.ac.ir/article-1-3294-fa.html
داودی مهرنوش، ضیاء جهرمی نوشا. بررسی میزان بیان lncRNA DSCR9 در بیماران مبتلا به سرطان کولورکتال. مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی بیرجند. 1402; 30 (2) :131-140
1- گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران
2- گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران ،Nooshazia.59@gmail.com
2- گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران ،
چکیده: (987 مشاهده)
زمینه و هدف: بررسی‌ها نشان داده است که DSCR lncRNA از سرطان و التهاب جلوگیری می‌کند و بیان آن منجر به فعالیت‌های ضد توموری می‌شود. بنابراین هدف از این تحقیق بررسی ارتباط میزان بیان lncRNA DSCR9 با خطر ابتلا به سرطان روده بزرگ بود.
روش تحقیق: از 20 نمونه بافت بیماران مبتلا به سرطان کولورکتال و 20 بافت سالم روده افراد سالم نمونه‌گیری انجام شد. استخراج Total RNA و سپس سنتز cDNA انجام شد. بررسی بیان lncRNA DSCR9 با استفاده از روش Real time RT PCR و پرایمرهای طراحی شده با استفاده از نرم‌افزار Beacon Designer انجام شد. میزان بیان نسبی lncRNA DSCR9 محاسبه شد و در نهایت توسط نرم‌افزار GraphPad Prism نتایج مورد تحلیل قرار گرفت.
یافته‌ها: نتایج نشان داد که بیان DSCR9 lncRNA در سرطان کولورکتال در مقایسه با گروه کنترل و همچنین در تومور افراد دارای متاستاز و فاقد متاستاز افزایش یافت. از طرفی بیان نسبی DSCR9 lncRNA در تومور افراد دارای مرحله 1 و 2 و در افراد دارای تومور با اندازه متفاوت افزایش معناداری را نشان نداد؛ اما بیان نسبی lncRNA DSCR9 در تومور افراد دارای گرید 1 و 2 افزایش بیان داشت و از نظر آماری معنا‌دار بود (0/0144P=). بررسی اختصاصیت و حساسیت lncRNA DSCR9 نشان داد که به‌عنوان یک نشانگر (0/0001P=) میتواند جمعیت بیمار را از سالم جدا کند.
نتیجه‌گیری: در تحقیق حاضر بیان نسبی lncRNA DSCR9 در افراد مبتلا به سرطان کولورکتال در مقایسه با کنترل افزایش بیان داشت که احتمالاً میتواند به دلیل فعال کردن پروتئینهای دخیل در سرطان و افزایش مسیر سیگنالینگ Wnt/beta-catenin باشد و باعث رشد سلول‌های تومور و رگ‌زایی در سرطان باشد. بنابراین با توجه به تغییرات بیان ژن DSCR9 lncRNA در سرطان کولورکتال احتمالاً می‌توان از این ژن به عنوان یک نشانگر زیستی برای تشخیص تومور استفاده نمود.
* مسئول مکاتبات: نوشا ضیاء جهرمی
پست الکترونیکی: Nooshazia.59@gmail.com
روش تحقیق: از 20 نمونه بافت بیماران مبتلا به سرطان کولورکتال و 20 بافت سالم روده افراد سالم نمونه‌گیری انجام شد. استخراج Total RNA و سپس سنتز cDNA انجام شد. بررسی بیان lncRNA DSCR9 با استفاده از روش Real time RT PCR و پرایمرهای طراحی شده با استفاده از نرم‌افزار Beacon Designer انجام شد. میزان بیان نسبی lncRNA DSCR9 محاسبه شد و در نهایت توسط نرم‌افزار GraphPad Prism نتایج مورد تحلیل قرار گرفت.
یافته‌ها: نتایج نشان داد که بیان DSCR9 lncRNA در سرطان کولورکتال در مقایسه با گروه کنترل و همچنین در تومور افراد دارای متاستاز و فاقد متاستاز افزایش یافت. از طرفی بیان نسبی DSCR9 lncRNA در تومور افراد دارای مرحله 1 و 2 و در افراد دارای تومور با اندازه متفاوت افزایش معناداری را نشان نداد؛ اما بیان نسبی lncRNA DSCR9 در تومور افراد دارای گرید 1 و 2 افزایش بیان داشت و از نظر آماری معنا‌دار بود (0/0144P=). بررسی اختصاصیت و حساسیت lncRNA DSCR9 نشان داد که به‌عنوان یک نشانگر (0/0001P=) میتواند جمعیت بیمار را از سالم جدا کند.
نتیجه‌گیری: در تحقیق حاضر بیان نسبی lncRNA DSCR9 در افراد مبتلا به سرطان کولورکتال در مقایسه با کنترل افزایش بیان داشت که احتمالاً میتواند به دلیل فعال کردن پروتئینهای دخیل در سرطان و افزایش مسیر سیگنالینگ Wnt/beta-catenin باشد و باعث رشد سلول‌های تومور و رگ‌زایی در سرطان باشد. بنابراین با توجه به تغییرات بیان ژن DSCR9 lncRNA در سرطان کولورکتال احتمالاً می‌توان از این ژن به عنوان یک نشانگر زیستی برای تشخیص تومور استفاده نمود.
* مسئول مکاتبات: نوشا ضیاء جهرمی
پست الکترونیکی: Nooshazia.59@gmail.com
You can also search for this author in: PubMed ResearchGate Scopus Google Scholar Google Scholar Profile
نوع مطالعه: مقاله اصیل پژوهشی |
موضوع مقاله:
بيوشيمي
دریافت: 1402/3/31 | پذیرش: 1402/7/1 | انتشار الکترونیک پیش از انتشار نهایی: 1402/7/9 | انتشار الکترونیک: 1402/7/15
دریافت: 1402/3/31 | پذیرش: 1402/7/1 | انتشار الکترونیک پیش از انتشار نهایی: 1402/7/9 | انتشار الکترونیک: 1402/7/15
فهرست منابع
1. Sadat Kia F, Nazemalhosseini-Mojarad E, Forouzesh F. A quantitative investigation of the Bid gene expression in biopsies from colorectal adenomas. Tehran Univ Med J. 2018; 76(2): 120-8. [Persian] URL: http://tumj.tums.ac.ir/article-1-8772-en.html.
2. Setareh S, Zahiri Esfahani M, Zare Bandamiri M, Raeesi A, Abbasi R. Using Data Mining for Survival Prediction in Patients with Colon Cancer. Iran J Epidemiol. 2018; 14(1): 19-29. [Persian] URL: http://irje.tums.ac.ir/article-1-5961-en.html.
3. Pourfarzi F, Yazdanbod A, Daneshvar R, Saberi SH. Evaluation of effective factors in incidence of colorectal cancer. J Ardabil Univ Med Sci. 2012; 12(5): 56-64. [Persian] URL: http://jarums.arums.ac.ir/article-1-99-en.html.
4. Han-Shiang C. Curative resection of colorectal adenocarcinoma: multivariate analysis of 5-year follow-up. World J Surg. 1999; 23(12): 1301-6. DOI: 10.1007/s002689900666. [DOI:10.1007/s002689900666] [PMID]
5. Nadeem MS, Kumar V, Al-Abbasi FA, Kamal MA, Anwar F. Risk of colorectal cancer in inflammatory bowel diseases.Semin Cancer Biol. 2020;64: 51-60. DOI: 10.1016/j.semcancer.2019.05.001 [DOI:10.1016/j.semcancer.2019.05.001] [PMID]
6. Dehghan H, Salari A. Evaluation and treatment of colorectal cancer in Shahid Rahnemoon and Afshar hospitals, Yazd-Iran. J Shaheed Sadoughi Univ Med Sci. 2007; 15(3): 20-5. URL: http://jssu.ssu.ac.ir/article-1-644-en.html
7. Chen X, Yan G-Y. Novel human lncRNA-disease association inference based on lncRNA expression profiles. Bioinformatics. 2013; 29(20): 2617-24. DOI: 10.1093/bioinformatics/btt426 [DOI:10.1093/bioinformatics/btt426] [PMID]
8. Consortium IHGS. Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature. 2001; 409(6822): 860. DOI: 10.1038/35057062 [DOI:10.1038/35057062] [PMID]
9. Carter G, Miladinovic B, Patel AA, Deland L, Mastorides S, Patel NA. Circulating long noncoding RNA GAS5 levels are correlated to prevalence of type 2 diabetes mellitus. BBAClin. 2015; 4: 102-7. DOI: 10.1016/j.bbacli.2015.09.001 [DOI:10.1016/j.bbacli.2015.09.001] [PMID] []
10. Yu B, Liu L, Sun H, Chen Y. Long noncoding RNA AK056155 involved in the development of Loeys-Dietz syndrome through AKT/PI3K signaling pathway. Int J Clin Exp Pathol. 2015; 8(9): 10768-75. PMID: 26617788
11. Chen G, Wang Z, Wang D, Qiu C, Liu M, Chen X, et al. LncRNADisease: a database for long-non-coding RNA-associated diseases. Nucleic Acids Res. 2012; 41(D1): D983-D6. DOI: 10.1093/nar/gks1099 [DOI:10.1093/nar/gks1099] [PMID] []
12. Guo Z-H, You Z-H, Wang Y-B, Yi H-C, Chen Z-H. A learning-based method for LncRNA-disease association identification combing similarity information and rotation forest. J IScience. 2019; 19: 786-95. DOI: 10.1016/j.isci.2019.08.030. [DOI:10.1016/j.isci.2019.08.030] [PMID] []
13. Minami T. Down Syndrome Expressed Protein; DSCR-1 Deters Cancer and Septic Inflammation. Genetics and Etiology of Down Syndrome. 2011: 121. DOI: 10.5772/20975 [DOI:10.5772/20975]
14. Chen M, Wang J, Luo Y, Huang K, Shi X, Liu Y, et al. Identify Down syndrome transcriptome associations using integrative analysis of microarray database and correlation-interaction network. Hum Genomics. 2018; 12(1): 1-12. DOI: 10.1186/s40246-018-0133-y [DOI:10.1186/s40246-018-0133-y] [PMID] []
15. Ferns R, Nastouli E, Garson J. Quantitation of hepatitis delta virus using a single-step internally controlled real-time RT-qPCR and a full-length genomic RNA calibration standard. J Virol Methods. 2012; 179(1): 189-94. DOI: 10.1016/j.jviromet.2011.11.001 [DOI:10.1016/j.jviromet.2011.11.001] [PMID]
16. Baek K-H, Zaslavsky A, Lynch RC, Britt C, Okada Y, Siarey RJ, et al. Down's syndrome suppression of tumour growth and the role of the calcineurin inhibitor DSCR1. J Nature. 2009; 459(7250): 1126-30. DOI: https://www.nature.com/articles/nature08062 [DOI:10.1038/nature08062] [PMID] []
17. Cho S-H, Jeon J, Kim SI. Personalized medicine in breast cancer: a systematic review. J Breast Cancer. 2012; 15(3): 265-72. DOI: 10.4048/jbc.2012.15.3.265 [DOI:10.4048/jbc.2012.15.3.265] [PMID] []
18. Vitiello M, Tuccoli A, Poliseno L. Long non-coding RNAs in cancer: implications for personalized therapy. Cell Oncol (Dordr). 2015; 38(1): 17-28. DOI: 10.1007/s13402-014-0180-x [DOI:10.1007/s13402-014-0180-x] [PMID]
19. Lv C, Liu D, Wei X. Down syndrome critical region 1 positively correlates with angiogenesis in hypopharyngeal cancer. Mol Med Rep. 2017; 15(1): 263-70. DOI: 10.3892/mmr.2016.5989 [DOI:10.3892/mmr.2016.5989] [PMID]
20. Seo DS, Chau GC, Baek K-H, Um SH. A single extra copy of Down syndrome critical region 1-4 results in impaired hepatic glucose homeostasis. Mol Metab. 2019; 21: 82-9. DOI: 10.1016/j.molmet.2018.12.002 [DOI:10.1016/j.molmet.2018.12.002] [PMID] []
21. Zhuang H, Huang S, Zhou Z, Ma Z, Zhang Z, Zhang C, et al. A four prognosis-associated lncRNAs (PALnc) based risk score system reflects immune cell infiltration and predicts patient survival in pancreatic cancer. Cancer Cell Int. 2020; 20(1): 1-10. DOI: 10.1186/s12935-020-01588-y [DOI:10.1186/s12935-020-01588-y] [PMID] []
22. Wu X, Liu J, Zhu C, Ma M, Chen X, Liu Y, et al. Identification of Potential Biomarkers of Prognosis-Related Long Non-Coding RNA (lncRNA) in Pediatric Rhabdoid Tumor of the Kidney Based on ceRNA Networks. Med Sci Monit. 2020; 26: e927725-1-9. DOI: 10.12659/MSM.927725 [DOI:10.12659/MSM.927725]
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
Attribution-NoneCommercial CC BY-NC