دوره 26، شماره 2 - ( تابستان 1398 )                   جلد 26 شماره 2 صفحات 118-127 | برگشت به فهرست نسخه ها


XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Eestanesti Z, Sarir H, Farhangfar H, Behdani E. Gene regulation network fitting of genes involved in the pathophysiology of fatty liver in the mice by promoter mining. J Birjand Univ Med Sci.. 2019; 26 (2) :118-127
URL: http://journal.bums.ac.ir/article-1-2610-fa.html
استانستی زهرا، سریر هادی، فرهنگ فر همایون، بهدانی الهام. برازش شبکه تنظیم ژنی ژن‌های مؤثر در پاتوفیزیولوژی کبد چرب موش به‌وسیله کاوش پروموتری. مجله علمي دانشگاه علوم پزشكي بيرجند. 1398; 26 (2) :118-127

URL: http://journal.bums.ac.ir/article-1-2610-fa.html


1- گروه علوم دامی، دانشگاه بیرجند، بیرجند، ایران ، estanesti.zahra@gmail.com
2- گروه علوم دامی، دانشگاه بیرجند، بیرجند، ایران
3- گروه علوم دامی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان، اهواز، ایران
چکیده:   (492 مشاهده)
زمینه و هدف: بیماری کبد چرب غیرالکلی (NAFLD)، علت اصلی بیماری مزمن کبدی در کشورهای توسعه‌یافته است. در این مطالعه، به شناسایی مهم‌ترین فاکتورهای رونویسی و سازوکارهای بیولوژیکی مؤثر بر بروز بیماری کبد چرب با استفاده از داده‌کاوی ناحیه پروموتری، پرداخته شد.
روش تحقیق: در این مطالعه، ابتدا ژن‌های نشانگر مرتبط با این بیماری یافت شدند و الگوی اتصال فاکتورهای رونویسی با نرم‌افزار Genomatix بررسی گردید. در کل ژنوم، ژن‌هایی که الگوی اتصال مشابهی برای فاکتورهای رونویسی به ناحیه پروموتری داشتند، به‌عنوان ژن‌های احتمالی مؤثر بر کبد چرب شناسایی شدند. با استفاده از نرم‌افزار Cytoscape (3.6.0)، شبکه برهمکنش فاکتورهای رونویسی و ژن‌های هدف ترسیم گردید. در نهایت مهم‌ترین مسیرهای بیولوژیکی مرتبط با ژن‌های به‌دست آمده از کبد چرب، با استفاده از پایگاه اطلاعاتی DAVID بررسی شد.
یافته‌ها: برازش شبکه برهمکنش پروتئینی نشان داد که فاکتورهای رونویسی Creb1، Jun و Max و ژن‌های Gsk3b، Ddit3 وSfpi1 در بروز این بیماری مهم‌ترین نقش را دارا هستند. آنالیز ژن آنتولوژی حاصل از مطالعه نیز نشان داد، مسیرهای بیولوژیکی شامل: آپاپتوز، سیگنال‌های درون‌سلولی و بیوسنتز ترکیبات آروماتیک و مسیرهای سیگنال‌دهی ریتم‌های شبانه روزی، کبد چرب غیر الکلی و سیگنال‌های کموکاین، در بروز عارضه کبد چرب دخیل هستند.
نتیجه‌گیری: افزایش بیان فاکتورهای رونویسی و ژن‌های به‌دست آمده می‌تواند یکی از عوامل مؤثر بر بروز این بیماری باشد؛ همچنین مسیرهای بیولوژیکی آپاپتوز، سیگنال‌های درون‌سلولی و بیوسنتز ترکیبات آروماتیک و مسیرهای سیگنال‌دهی ریتم‌های شبانه‌روزی، کبد چرب غیر الکلی و سیگنال‌های کموکاین در عارضه کبد چرب مهم به‌شمار می‌آیند.
 
متن کامل [PDF 893 kb]   (111 دریافت) |   |   متن کامل (HTML)  (57 مشاهده)  
نوع مطالعه: مقاله اصیل پژوهشی | موضوع مقاله: ژنتيك پزشكي
دریافت: ۱۳۹۷/۱۰/۲۲ | پذیرش: ۱۳۹۸/۲/۱۶ | انتشار: ۱۳۹۸/۳/۲۹

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی بیرجند می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2019 All Rights Reserved | Journal of Birjand University of Medical Sciences

Designed & Developed by : Yektaweb