fa بررسی ژنومیک و بیوانفورماتیکی تغییرات نوکلئوتیدی نواحی کدینگ ژن CCDC103 در بیماران مبتلا به تترالوژی فالوت (TOF): یک نوع نقص قلبی مادرزادی ژنتيك پزشكي Medical Genetics مقاله اصیل پژوهشی Original Article <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:10pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span b="" lang="AR-SA" mitra="" style="font-family:">زمینه و هدف:</span></b><span lang="AR-SA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:"> تترالوژی فالوت (</span></span>TOF<span lang="AR-SA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">) یکی از شایع&shy;ترین انواع پیچیده از </span></span><span lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">نقایص مادرزادی قلبی (</span></span>CHD<span lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">) در نوزادان است. مکانیسم‌های مولکولی متعددی ممکن است در ایجاد آن نقش داشته باشند، مانند جهش در اجزای شبکه ژنی قلب، مسیرهای تنظیم ژن‌های قلبی، اختلال در عملکرد ژن‌های بیان‌کننده مژک و اختلال در عملکرد ژن‌های تعیین‌کننده محور چپ و راست قلب. نقص در عملکرد یا مونتاژ این ساختارها که در تحرک و مهاجرت سلول‌ها نقش دارند، با اختلالات مادرزادی قلب همراه است. هدف مطالعه حاضر، بررسی</span></span> <span lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">تغییرات نوکلئوتیدی ژن </span></span><i>CCDC103</i> <span lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">و ارتباط آن با نقایص قلبی مادرزادی از نوع </span></span>TOF <span lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">است.</span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:11.0pt"><span style="font-family:"B Mitra""></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:10pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span b="" lang="AR-SA" mitra="" style="font-family:">روش تحقیق:</span></b> <span lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">این مطالعه مورد-شاهدی برای اولین‌بار در ایران، به‌صورت مورد-شاهدی، در 85 کودک بیمار مبتلا به </span></span>TOF <span lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">و 56 کودک سالم، بدون سابقه خانوادگی اختلالات قلبی به عنوان گروه کنترل انجام شد. برای ارزیابی جهش‌های نقطه‌ای در ژن </span></span><i>CCDC103</i><span lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">، از روش </span></span>Touchdown PCR<span lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:"> و توالی‌یابی </span></span>Sanger <span lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">استفاده شد. به‌منظور پیش‌بینی تأثیر تغییرات نوکلئوتیدی بر روی ساختار و عملکرد پروتئین، از پایگاه‌های بیوانفورماتیکی استفاده شد.</span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:11.0pt"><span style="font-family:"B Mitra""></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:10pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span b="" lang="AR-SA" mitra="" style="font-family:">یافته‌ها:</span></b> <span lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">در مجموع 5 تغییر تک‌نوکلئوتیدی به‌صورت هتروزیگوت در این ژن شناسایی شد (سه جهش بدمعنی: </span></span>p.S115R<span lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">، </span></span>p.C191R<span lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:"> و </span></span>p.M201V<span lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">، یک تغییر همنام و بدون تغییر اسیدآمینه و همچنین یک تغییر درناحیه </span></span>3&#39;-UTR<span lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">). نتایج بیوانفورماتیک نیز پیش‌بینی کردند که جهش </span></span>p.C191R<span style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:"> بیماری‌زا و آسیب‌رسان است.</span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:11.0pt"><span style="font-family:"B Mitra""></span></span></span></span></span></span><br> <span style="font-size:10pt"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span b="" lang="AR-SA" mitra="" style="font-family:">نتیجه‌گیری:</span></b> <span lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">نتایج<b> </b>این مطالعه تأیید می‌کند که علاوه بر ژن‌های شناخته‌شده در بیماری‌زایی </span></span>TOF<span lang="FA" style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:">، تغییراتی ژن </span></span><i>CCDC103</i><span style="font-size:11.0pt"><span b="" mitra="" style="font-family:"> در مسیر سیگنالینگ مژگانی نیز می‌تواند در ایجاد نقایص قلبی نقش داشته باشد.</span></span><span lang="AR-SA" style="font-size:11.0pt"><span style="font-family:"B Mitra""></span></span></span></span></span></span></div> <div style="text-align: justify;"><span style="font-size:10pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="font-size:11.0pt">Background and Aims:</span></b><span style="font-size:11.0pt"> Tetralogy of Fallot (TOF) is one of infants&#39; most common types of complex congenital heart defects (CHD).</span> <span style="font-size:11.0pt">Several molecular mechanisms may play a role in its development, such as mutations in cardiac gene network components, cardiac gene regulatory pathways, dysfunction of cilia-expressing genes, and dysfunction of genes determining the left and right axis of the heart. The present study aimed to investigate the nucleotide changes of the <i>CCDC103</i> gene and its relationship with CHD of the TOF type.</span><span style="font-size:11.0pt"></span></span></span><br> <span style="font-size:10pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="font-size:11.0pt">Materials and Methods:</span></b><span style="font-size:11.0pt"> The present work was conducted for the first time in Iran as a case-control study on 85 children with TOF. The control group involved 56 healthy children without a family history of heart disorders. Touchdown polymerase chain reaction (PCR) and Sanger sequencing were used to evaluate point mutations in the <i>CCDC103</i> gene. Moreover, bioinformatics databases were employed to predict the impact of nucleotide changes on protein structure and function.</span></span></span><br> <span style="font-size:10pt"><span style="text-justify:kashida"><span style="text-kashida:0%"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><b><span style="font-size:11.0pt">Results:</span></b><span style="font-size:11.0pt"> A total of five heterozygous single nucleotide changes were detected in this gene (three missense mutations: p.S115R, p.C191R, p.M201V, a synonymous change without amino acid change, and a change in the 3&#39;-UTR region). In addition, bioinformatics results predicted that p.C191R mutation is pathogenic and harmful.</span></span></span></span></span><br> <b><span style="font-size:11.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times="">Conclusion:</span></span></b><span style="font-size:11.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""> The results indicated that in addition to the genes known in the pathogenesis of TOF, changes in the <i>CCDC103</i> gene in the ciliary signaling pathway can play a role in causing heart defects.</span></span></div> CCDC103, مژک, تکوین قلب, تترالوژی فالوت, نقایص قلبی مادرزادی CCDC103 gene, Celia, Cardiac development, Congenital heart disease, Tetralogy of Fallot 48 67 http://journal.bums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3605-4&slc_lang=fa&sid=1 Zahra Moghadambarati زهرا مقدم براتی zz_moghadam75@yahoo.com 8700319475328460048745 0009-0001-2479-7566 No Department of Biology, Faculty of Science, Yazd University, Yazd, Iran گروه زیست شناسی، دانشگاه یزد، یزد، ایران Mehri Khatami مهری خاتمی m.khatami@yazd.ac.ir 8700319475328460048746 8700319475328460048746 Yes Department of Biology, Faculty of Science, Yazd University, Yazd, Iran گروه زیست شناسی، دانشگاه یزد، یزد، ایران Mohammad Mehdi Heidari محمد مهدی حیدری heidarimm@yazd.ac.ir 8700319475328460048747 8700319475328460048747 No Department of Biology, Faculty of Science, Yazd University, Yazd, Iran گروه زیست شناسی، دانشگاه یزد، یزد، ایران Mehdi HadadZadeh مهدی حدادزاده Mehad51@yahoo.com 8700319475328460048748 8700319475328460048748 No Department of Cardiac Surgery, Afshar Hospital, Shahid Sadoughi University of Medical Sciences, Yazd, Iran بخش جراحی قلب، بیمارستان افشار، دانشگاه علوم پزشکی شهید صدوقی، یزد، ایران Reihane Ghorbanian ریحانه قربانیان reihaneghorbanian@gmail.com 8700319475328460048749 8700319475328460048749 No Department of Biology, Faculty of Science, Yazd University, Yazd, Iran گروه زیست شناسی، دانشگاه یزد، یزد، ایران